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“DNA存储:这是用“生命”来存储数据”

来源:陕西时报网作者:李子光更新时间:2021-04-13 17:11:02 阅读:

本篇文章3806字,读完约10分钟

我们知道在dna (脱氧核糖核酸)里保存着生物的生命新闻和遗传指令。 要保存人工数字新闻吗? 还没听说过。

日前,欧洲生物新闻研究所( ebi )的古德曼博士及其团队在《自然》杂志今年1月号上发表了用dna保存数字新闻的研究。 文案详述了实验的总体思路、具体做法和结果、费用的分解。 学术界和业界备受瞩目,被誉为新闻存储行业的里程碑。

所以,数字新闻存储是新闻社会的烫手山芋。 网络时代,数字信息轰炸正以天文级数增长。 根据美国idc企业最新的研究报告,全球生成和复制的数字新闻总量近3个zb(zb是新闻量的单位,等于10的21次方)。 一般的gb是10的9次方)。 idc预测,数字新闻总量将每两年以两倍的速度增长,年达到40zb。 这个到底多少钱? 例如,你明白了。 世界上所有的海滩加起来,大约有700、500、000、000、000、000、000、000、000粒沙粒。 40个zb是这个沙粒总量的57倍。 届时,我们的中国产新闻将占全世界的22%。 如此巨大的新闻量,利润显而易见。 很多前人无法想象、难以完成的事情,我们现在拿起手机,点击了几次,就做了。 古人说秀才不出门,知天下,不就是今天网民生活的写照吗? 商业活动对网络新闻至关重要。 例如,任何全球连锁店都可以实时收集和分析各地分店的销售库存数据,随时调整订单的进货,降低价格,提高利润。 这类东西不胜枚举。 由此,新学科——大数据也得到了迅速发展。

“DNA存储:这是用“生命”来存储数据”

但是,有一利必有一害。 庞大的新闻在存储器空之间紧急呼唤,人工费不堪负担。 总部设在瑞士的欧洲核研究机构( cern )就是一个典型的例子。 该组织负责大型强子对撞机的运行和数据观察,每年产生约pb(pb为10的15次方)的数据,每年增加到50~60Pb,相当于常规dvd的180万张以上的库存。 规定,这些数据存档后,必须保存20年以上,保存在恒温恒湿的环境中。 此外,每3-4年,整个数据文件都会复制到新的存储介质上,以确保新闻的安全性,并便于与新一代计算设备和技术匹配。 请考虑一下。 要保留和维护这个数据集,必须占多少地方、花多少钱、花多少劳力? 这还只是一个机构的困难。 所以,可以减压的发明创造,将受到热烈欢迎。

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因此,科学家一直在努力寻找新技术、新方法、新媒体,处理存储问题。 从大软盘到小软盘,再到光盘,现在都是u盘。 硬盘、磁带、云存储等新品种层出不穷。 但是,记忆能力的增加就像矮人一样,远远跟不上新闻的步伐。 结果,决策者必须选择保证新闻的完善和节约费用,这常常非常棘手。 现在,古德曼博士告诉我们,他们的发明可以让一克重的dna记住2.2个pb新闻量。 换言之,cern每年用约28克的dna处理60个pb的数据。 你,大家不要兴奋!

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顺便说一下,dna的存储性能,这不是新的发现。 已知地球上所有生物的基因新闻都存在于dna上,我们每个人的身体都有约30亿个碱基对。 但是,dna是为了保存数字新闻,在科学上又偶然相遇的惊喜。 阿基米德泡在浴室里想出浮力定律,牛顿躺在苹果树下发现重力。 古德曼和同事在研究所附近的酒吧里泡的时候,突然有了灵感,有了创意后马上拿出了钢笔,把保存在dna数字新闻里的一套代码设计写在了纸巾上。

如果能够用dna保存数字新闻,当然是理想的。 只是实现并不容易,还必须突破很多技术难关。 年份似乎是个转折点。 古德曼和哈佛大学的george church团队相继发表了各自的研究成果,但前者的成果更完整、可操作、实用。 church教授评价说,为了古德曼的团队工作,我们终于有了真正的行业。

根据古德曼博士的报告,dna记忆数字新闻的原理和过程似乎不太复杂。 用特定的碱基编码,把电子文档嵌入dna,合成后就剩下了。 获取新闻时,可以使用dna测序仪,按照代码规则将该dna序列转换为电子文档进行解读,从而应用于计算机。 因此,编码设计是dna数字新闻存储成功的关键。 数字新闻种类繁多,是数量迅速增长的整合。 因此,编码需要足够的能力来编辑无限放大的新闻集,如实记录其中的所有分子,准确度为100%,也不允许有半点错误。

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古德曼队干的。 他们的做法是,首先将电子文档的二进制代码( 0,1 )翻译成二进制代码( 0,1,2 )。 然后,通过由dna的4个碱基(分别以学名的首字母a、t、c、g为代表)组成的一组特定的代码和规则,将三进制代码编译成一个dna代码数组。 接着,将该dna序列每次向后偏移25个碱基,得到序列整体的4个拷贝(例如1、2、3、4; 三、四、一; 三、四、一、二; 四,一,二,三)。 因此,如果其中一个副本有错误,其他三个副本将用于参考验证,可以说没有错误。 为了弄清这些等长片段在这个dna序列中的准确位置,古德曼的团队在各自的首尾上做了索引标记。 生成dna代码生成电子文件后,用专业设备进行dna合成,报纸的记录就完成了。 提取合成dna的新闻时,首先将合成dna放入标准化学试剂,然后使用dna测序仪,基于索引标记,将各片段依次粘接在原dna代码序列上,翻译成二进制代码形成电子文档,从而完成。 古德曼团队非常谨慎,不惜繁琐的编码设计,引入了多种纠错机制,以保证编辑和解密的恢复达到零误差。

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编码设计后,高盛团队用5种电子文件进行了测试。 是26秒钟的马丁·。 路德·金《我有一个梦想》的演讲录音。 关于dna结构的经典学术论文的pdf文件莎士比亚的14行诗全篇,是ebi大厦的彩色照片。 这次实验采用的软件算法( a Huffman代码)。 新闻总量不大。 约739千字节,重点验证代码在不同新闻格式、副本和样式中的应用能力。 dna的记忆能力确实惊人,当这装了五个文件的合成dna的试管送到高盛手里时,他看了半天,什么也没发现。 还是被同事指出,发现了试管底部灰尘一样大小的dna。

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然后,小组使用dna测序仪将合成dna中的新闻恢复成了电子文档。 结果令人兴奋:与原始电子文档的匹配率为100%。 但是,这100%接在没有惊讶和危险的小故事之后。 在dna测序中,pdf文档中的两个25碱基小节消失了。 如果缺少它们,绝对不允许出现误差。 幸运的是,编码为每个部分提供了四个副本,根据副本,编码准确地完成了恢复任务。 这次的失真显示了防止该编码错误的良好性能。 幸运的是,小组很快就找到了丢失的原因。 高博士保证只要稍微修改一下程序,同样的问题就不会再发生了。

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编码实验成功! 迈出重要的一步,dna还可以实现作为新闻记忆媒体的其他优秀性能。 不仅记忆密度高,dna还有一点突出的优点。 因为很容易留下来,所以只需要放在寒冷、阴暗、干燥的地方,没有恒温恒湿的严格要求。 它还非常稳定,保管几百万年也没问题,不会变形。 另外,合成测序,采用的设备和方法是生物学研究的常规工具。 由此,dna的存储比较有效地避免了设备技术更新换代带来的诸多麻烦。 因此,dna是数字新闻长期保存的理想材料,保存时间越长越能显示出优势。

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那样的话,能期待在不久的将来使用dna磁盘,忘记新闻存储的担心吗? 还是那句话,利害相符。

dna作为存储介质也有突出的弱点。 首先是价格太高了。 古德曼团队的实验费用高得惊人:每万亿( mb,10的6次方)字节的存储费用为12,400美元,测序破解220美元。 这是普通磁带刻录费用的100万倍以上。 别说个人了,就是尖端科学研究也没用哦。 因此,为了实现实用化,dna存储需要大幅降低价值成本。 第二,报纸的写法非常花时间。 数字新闻嵌入式dna目前只能由专业的dna合成设备完成。 从dna读取新闻,重新构成数字文档并恢复也需要时间。 古德曼团队花了整整两周的时间,完成了5个文件的739千字节的复原。 第三,dna介质不能重复使用,写入完成,通常不能写入,不能重复使用。 但是,我们把硬盘和u盘等普通存储的便利性作为习性。 10美元购买16gb内存的u盘插入计算机后,可以写拷贝、计算、听音乐、看视频。 人机(内存)之间的无缝交流是我们普通人的标准,几乎是一体化的。 这些简单的基本功能无法承受dna介质。 所以,dna存储介质离实际应用还有很长一段路。

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幸运的是,科学家大多是乐观派。 高盛团队对整个dna的研究迅速发展和代码本身的改善充满信心,认为dna媒体将用于数字新闻的长时间保存,前景光明。 另外指出,虽然dna的起始费用很高,但一次也不会重复。 之后的保养费用极低,几乎可以不计入。 反观以往的媒体,初期费用低,但后续费用高,人工费也大。 戈德曼的团队计算,按照目前的价格,需要留下600多年的新闻,使用dna存储则成本高昂。 也就是说,保存600年可以使dna一次不重复的费用与普通介质的长时间维持费用相同。 但是,根据近年来dna合成和测序费用大幅减少的趋势,10多年来价格有望下降100倍。 如果是这样的话,保存了50多年,不需要多次访问的新闻,dna介质就很有竞争力。

“DNA存储:这是用“生命”来存储数据”

研究历史的朋友听到这个故事,大为感叹:这样就好了。 不仅可以将无数历史籍乃至图书馆注册进dna,我们的日常生活也可以为后世留下影像声音的文字,让千秋万代以后的他们,接触到真实的我们。

啊,那多好啊! dna与数字新闻携手,支撑生命的东西,演绎着生命造物永远存在的未来故事。

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